なにがちがうん？
一般的に言われているポップアップとはｊｓのwindow.openで表示されているポップアップ・ウィンドウの事をいう

ｉｅのポップアップブロックは大概の場合ｊｓのwindow.openの時に起こる。
けどたまにポップアップブロックの設定を「高」とかにしているとtarget _blankの時にも引っかかってしまうそうな

引用
2009/12/3　IEのポップアップ ブロック フィルタレベル［高］に注意
http://www.sysgathe.com/2009/12/ie-1.html

firefoxは
ポップアップブロックの設定を「中」：許可されたサイトでのポップアップはブロックしない
ポップアップブロックの設定を「高」：すべてのポップアップをブロックする（ただしユーザーのクリックイベントで発生したポップアップはブロックしない）